La storia di Porto Cesareo è sempre stata, nel tempo, condizionata dalla sua posizione geografica che pone il paese come un balcone affacciato su uno dei mari più belli d'Italia. "Portus Sasinae", all'origine, subì l'influenza greca, come dimostrano le ceramiche micenee, ma fu ancor prima città messapica, in cui sorgeva un insediamento per la produzione della porpora e per la sua posizione strategica sul mare fu, infine, anche occupata dai Romani che la ribattezzarono "Cesarea" La vita si svolgeva intorno all'antica Torre di Carlo V, proprio al centro del paese. Dalla Torre si è ad un passo di mare dall'isola Grande, detta Isola dei Conigli, che ospita 200 specie di vegetali, alcune esclusive a causa della periodica sommersione delle aree più basse. Torri erette lungo tutta la costa (17 KM) e masserie fortificate sono tra i luoghi più suggestivi per escursioni turistiche. Incomparabili i colori di Porto Cesareo. I riflessi verde smeraldo del mare, il giallo solare delle dune di sabbia fine, il rosso ambrato del coralligeno e il blu intenso del cielo del Sud. Porto Cesareo è sito di un'area marina protetta ed ha la sede la "Stazione di Biologia Marina" divenuta struttura accademica nel 1977, comprende al suo interno gli spazi per il "museo di Storia Naturale Marina e della Pesca", una ricca collezione di conchiglie e di esemplari di flora e di fauna marine caratteristiche delle coste pugliesi.